81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3897 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  46.11 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.21 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  40.68 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  36.9 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  38.37 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  35.29 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  36.63 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  34.71 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  38.69 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  36.52 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  37.36 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  32.74 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  38.42 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  36.78 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  36.78 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  37.14 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  36.52 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  32.58 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  32.18 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  28.36 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  28.21 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.97 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.87 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.65 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  31.86 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.09 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  29.03 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  21.92 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  30.77 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  21.83 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  26.32 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.4 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  21.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  21.83 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  32.26 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  28.72 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  26.32 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  32.26 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  25.88 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  31.91 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.74 
 
 		 907 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  24.11 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  24.11 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  24.46 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  24.64 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  24.31 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  22.6 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  22.7 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  22.22 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  24.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  21.17 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  32.86 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  21.17 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  21.17 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  21.17 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  21.38 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  23.58 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  21.6 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  25.48 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  27.66 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  27.66 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.94 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  32.26 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  29.63 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  25 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  29.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  28.74 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  21.85 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  24.81 
 
 		 312 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  21.05 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  27.66 
 
 		 184 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  34.67 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  21.28 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  27.78 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.41 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.88 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.3 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  21.52 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  21.52 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>