67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1373 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  60.8 
 
 		 176 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  61.93 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  59.32 
 
 		 175 aa  204  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  56.25 
 
 		 176 aa  204  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  57.06 
 
 		 177 aa  202  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  60.45 
 
 		 175 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  58.76 
 
 		 175 aa  201  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  58.76 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  43.68 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3188  twitching motility signal transduction protein  49.72 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.572564  normal  0.255997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  32.57 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  31.03 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  31.03 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  30.73 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  32.18 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  32.78 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  34.29 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2550  CheW protein  34.09 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0670  putative twitching motility protein  29.89 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.43 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.43 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.29 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  25.5 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  30.19 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  25.88 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  36.44 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  29.75 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  33.04 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  23.21 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  23.35 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  22.92 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  23.31 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  25.81 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.69 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  25.44 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.92 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  23.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  24.65 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  24 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.92 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  23.89 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.55 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  23.42 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  25.18 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  26 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.74 
 
 		 164 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.96 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0056  CheW protein  38.6 
 
 		 162 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  31.17 
 
 		 178 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  24.11 
 
 		 179 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.95 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  22.12 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.14 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.14 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.14 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  21.71 
 
 		 205 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  36.54 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.96 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  29.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>