69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1096 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  92.31 
 
 		 221 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  91.63 
 
 		 215 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  77.38 
 
 		 221 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  59.91 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  56.33 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  56.33 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  57.64 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  57.21 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  42.2 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  39.91 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  40.85 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.56 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  41.74 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  41.36 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  38.86 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  37.77 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  30.77 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  34.82 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  34.93 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  34.93 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  34.93 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  34.93 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  34.63 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  36.96 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  33.6 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  33.6 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  38.82 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  38.82 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6784  CheW protein  32.86 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  34.65 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  24.44 
 
 		 140 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  33.66 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  34.65 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  27.7 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  27.7 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  20.75 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  28.87 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  26.35 
 
 		 299 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  26.35 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.56 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  22.54 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  31.09 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  33.68 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  27.54 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  27.54 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  27.54 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  26.85 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  26.03 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  35.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  31.58 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.84 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.71 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  41.51 
 
 		 161 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  25.9 
 
 		 169 aa  42  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  25.2 
 
 		 167 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  40.85 
 
 		 178 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  40.85 
 
 		 178 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.51 
 
 		 179 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  20 
 
 		 146 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  25.85 
 
 		 162 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  27.27 
 
 		 309 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  25.68 
 
 		 295 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  24.6 
 
 		 875 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  25 
 
 		 302 aa  41.6  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>