93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3682 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  94.54 
 
 		 240 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  83.4 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  83.4 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  83.4 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  84.52 
 
 		 235 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  82.19 
 
 		 247 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  58.2 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  56.8 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  56.8 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  56.8 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  56.8 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  56.35 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  50.83 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  55.07 
 
 		 201 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  55.07 
 
 		 201 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  46.46 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  40.77 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  37.77 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  38.98 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  38.36 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  38.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  37.18 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  38.36 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  37.83 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  40 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  28.12 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  39.13 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30.83 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30.83 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  34.02 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  32.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.97 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  27.59 
 
 		 163 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  29.3 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.76 
 
 		 158 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.81 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  26.54 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  27.49 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.27 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  26.54 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  24.16 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  25.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  27.27 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  28.03 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  25.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  26.67 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.53 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  23.24 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  23.24 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  23.24 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  27.4 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  23.24 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  23.24 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  22.97 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.1 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.48 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  23.24 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  26.57 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  22.54 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  22.54 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  22.54 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.41 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.22 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.52 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.47 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  27.37 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  25.69 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  24.83 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  31.58 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  27.27 
 
 		 157 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.39 
 
 		 161 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  24.18 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  26.29 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  27.73 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  29.5 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  23.49 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  39.34 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  39.34 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  28.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  22.62 
 
 		 159 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  27.37 
 
 		 342 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.57 
 
 		 169 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25.33 
 
 		 140 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  30.77 
 
 		 184 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25.87 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  24.83 
 
 		 157 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  24.65 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>