132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1306 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  100 
 
 		 229 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  88.65 
 
 		 229 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  72.85 
 
 		 227 aa  294  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  61.79 
 
 		 221 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  58.01 
 
 		 221 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  60.28 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  57.21 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  60.44 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  59.11 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  44.04 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  40.97 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  40.97 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  40.97 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  39.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  39.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  39.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  39.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  39.82 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  40.97 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  39.32 
 
 		 246 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  40.53 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  40.35 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  39.13 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.67 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  39.15 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  39.74 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  33.33 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  33.33 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  30.87 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  43.54 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  43.54 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.06 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.34 
 
 		 159 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  30.71 
 
 		 167 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25.69 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  25.53 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 163 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.54 
 
 		 159 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.34 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.22 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.34 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.65 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.34 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.34 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  28.06 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.06 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  21.68 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.54 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  24.83 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  24.81 
 
 		 147 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  24.81 
 
 		 147 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  24.41 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.93 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  25.85 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  26.62 
 
 		 161 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  29.2 
 
 		 167 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  27.66 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.78 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.49 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  23.87 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  30.28 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  24.66 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.21 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  25.68 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.17 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  28.67 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.9 
 
 		 161 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  27.27 
 
 		 155 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  24.84 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  25.9 
 
 		 164 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  24.66 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  25.9 
 
 		 164 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  22.22 
 
 		 154 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  21.95 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  25.68 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  29.46 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  29.58 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  28.87 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>