89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4943 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  100 
 
 
247 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  81.78 
 
 
238 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  80.57 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  80.57 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  80.57 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  80.97 
 
 
240 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  80.16 
 
 
235 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  59.92 
 
 
239 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  57.2 
 
 
244 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  57.2 
 
 
244 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  57.2 
 
 
244 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  57.2 
 
 
244 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  57.53 
 
 
246 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  50.4 
 
 
233 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  56.07 
 
 
201 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  56.07 
 
 
201 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  46.19 
 
 
226 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  41.15 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  40.08 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  39.44 
 
 
221 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  38.65 
 
 
221 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  39 
 
 
215 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  38.43 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  37.76 
 
 
225 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  39.92 
 
 
229 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  39.67 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  38.02 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  26.84 
 
 
246 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  35.8 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  31.09 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  27.33 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.56 
 
 
158 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.03 
 
 
165 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.03 
 
 
165 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.75 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  23.42 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  23.42 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  24.24 
 
 
160 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.78 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  23.68 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  23.68 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  23.68 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  23.68 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  23.68 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  23.18 
 
 
154 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  23.68 
 
 
302 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  30.06 
 
 
262 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  25.17 
 
 
159 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  23.03 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  23.03 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  23.03 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  26.14 
 
 
159 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  24.34 
 
 
158 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  24.34 
 
 
158 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  25.95 
 
 
149 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  27.44 
 
 
152 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  27.44 
 
 
152 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.38 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  22.52 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  25.83 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  24.84 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.42 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  24.84 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  23.23 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  27.39 
 
 
164 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  23.6 
 
 
907 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  23.13 
 
 
314 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  25.48 
 
 
140 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.27 
 
 
139 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  40.98 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  40.98 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  24.05 
 
 
148 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  26.97 
 
 
157 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26.54 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  24.05 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  21.43 
 
 
141 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  27.15 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30 
 
 
158 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  24.34 
 
 
155 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  40.68 
 
 
137 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  27.33 
 
 
159 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  24.34 
 
 
155 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  25.49 
 
 
155 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.22 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.11 
 
 
168 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  29.3 
 
 
152 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>