115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1496 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  88.65 
 
 		 229 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  72.85 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  62.04 
 
 		 221 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  57.14 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  59.81 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  56.71 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  56.64 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  56.44 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  41.82 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  40.09 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  40.09 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  40.09 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  40.27 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  37.87 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  40.09 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  38.36 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  38.36 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  38.36 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  38.36 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  39.65 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  38.03 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  38.91 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  38.7 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.67 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  37.99 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  33.33 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  33.33 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  30.32 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  41.5 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  41.5 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.49 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26.53 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  30.07 
 
 		 152 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  30.07 
 
 		 152 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.06 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.06 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.57 
 
 		 165 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  28.46 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  28.46 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.05 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.4 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.82 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.22 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.11 
 
 		 146 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  24.31 
 
 		 167 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.11 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.78 
 
 		 161 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.17 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  23.72 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  21.68 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.61 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  23.97 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  29.2 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  25 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  27.13 
 
 		 518 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.94 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.53 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.22 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  28.47 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.34 
 
 		 169 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  25.31 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.29 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  23.13 
 
 		 169 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.78 
 
 		 164 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  29.05 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.97 
 
 		 159 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  23.53 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  24.11 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.9 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  24.14 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.78 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  25.48 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  34.72 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  29.05 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  24.11 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.95 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.22 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  27.66 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.87 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  28.3 
 
 		 875 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  24.5 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  24.49 
 
 		 162 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  25.5 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>