196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1524 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  50.59 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  50.59 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  30.77 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  32.59 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  30.77 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  29.86 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  29.86 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  29.86 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  30.77 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  31.51 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  31.98 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  32.43 
 
 		 221 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  30.04 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  32.14 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  30.26 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  30.26 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  30.26 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  30.26 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  28.38 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  29.57 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  27.68 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  31.96 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  29.29 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  26.55 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  30.32 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  28.26 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  30.87 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  27.91 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  33.56 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  33.56 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  28.31 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  29.14 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  29.14 
 
 		 302 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  29.14 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  28.03 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  29.14 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  28.48 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  28.48 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  28.48 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  28.03 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1571  CheW-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 142 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.603726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  28.48 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  22.37 
 
 		 164 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  27.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 165 aa  52.4  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  28.66 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.84 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  24.05 
 
 		 159 aa  52  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  23.61 
 
 		 189 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  25 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  25 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  29.25 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  29.17 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  22.15 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  22.15 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.87 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.19 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  23.45 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  22.86 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  20.29 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  23.65 
 
 		 164 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.24 
 
 		 164 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  23.65 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  22.09 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  24.03 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  20.27 
 
 		 520 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  24.24 
 
 		 568 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  21.48 
 
 		 155 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  22.56 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  22.56 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  28.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  21.77 
 
 		 159 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  20.67 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  21.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  22.15 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  25 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  22.45 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  23.38 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  22.79 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  20.9 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  22.58 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  20.83 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  21.09 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  22.45 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  33.73 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  27.13 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  26.15 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  21.17 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  22.39 
 
 		 518 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  22.3 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.53 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  33.73 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  21.38 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  21.53 
 
 		 160 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  21.38 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  31.58 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  23.94 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  29.41 
 
 		 137 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>