64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5392 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  58.19 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  58.19 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  58.19 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  58.19 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  57.69 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  51.77 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  51.77 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  51.48 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  51.77 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  58.15 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  50.22 
 
 		 235 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  50.83 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  50.22 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  49.33 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  55.17 
 
 		 201 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  55.17 
 
 		 201 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  42.48 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  41.38 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  40.17 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  41.28 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  41.36 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  41.28 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  40.81 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  41.15 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  39.04 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  39.27 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  42.79 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  28.26 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  26.83 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  26.83 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.42 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.87 
 
 		 163 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  26.28 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  30 
 
 		 157 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25.17 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  25.71 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  25.71 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  23.12 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  27.94 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  21.68 
 
 		 146 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  23.84 
 
 		 152 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  23.84 
 
 		 152 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  26.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  24.66 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  30.08 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  28.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  25.17 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30.5 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  22.3 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  26.47 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.37 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  32.56 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  20.98 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  26.39 
 
 		 155 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  30.07 
 
 		 159 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  25.76 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  22.86 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0324  CheW protein  26.57 
 
 		 161 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  29.86 
 
 		 167 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  20.28 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  31.65 
 
 		 184 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  31.65 
 
 		 184 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>