84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1432 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  91.7 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  57.64 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  58.37 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  54.59 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  55.45 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  61.19 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  59.11 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  56.44 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  42.6 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  42.6 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  42.6 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  42.79 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  39.64 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  40.36 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  39.91 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  37.39 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  37.39 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  37.39 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  37.39 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  39.65 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  37.07 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  39.66 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  38.22 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  38.86 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  38.14 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  28.5 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  33.5 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  33.5 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  40.14 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  40.14 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.79 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.79 
 
 		 152 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  26.81 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.49 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  24.31 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25.66 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  25.36 
 
 		 154 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  24.31 
 
 		 167 aa  48.5  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  27.63 
 
 		 311 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  24.03 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.39 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0080  CheW protein  21.77 
 
 		 143 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0672928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  25 
 
 		 346 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  22.22 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  39.44 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  32.93 
 
 		 140 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.43 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.14 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  26.35 
 
 		 174 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  24 
 
 		 318 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  25.68 
 
 		 174 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  28.67 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  29.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.24 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  27.1 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  24.81 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  23.57 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  20.86 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  27.01 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  27.01 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  23.42 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  26.85 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.57 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  22.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  36.36 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  25.81 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  31.17 
 
 		 148 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  29.36 
 
 		 167 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5451  CheW protein  38.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.01 
 
 		 165 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  28.08 
 
 		 177 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  21.85 
 
 		 170 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  23.85 
 
 		 316 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  26.67 
 
 		 161 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  28.03 
 
 		 159 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  35.06 
 
 		 159 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  25.79 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  25.79 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.07 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>