More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0080 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0080  CheW protein  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0672928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  39.42 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  36.96 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.86 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  35.51 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  34.75 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.1 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.79 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.16 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.62 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  31.69 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.85 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  30.43 
 
 		 171 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.5 
 
 		 183 aa  88.6  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.91 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.88 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  34.72 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  34.72 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.06 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  26.95 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  33.57 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.17 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  34.56 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.43 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.12 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  28.06 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.17 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  35.51 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.29 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  35.25 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  34.93 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  26.24 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.77 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.35 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  36.76 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  28.06 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.66 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  27.34 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.83 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  27.34 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  32.64 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.62 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  35 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  29.77 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.06 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.46 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  29.77 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  33.82 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  32.17 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  28.99 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.18 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  31.06 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  41.05 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  26.62 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.21 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  24.46 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.18 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.18 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25.18 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.85 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25.18 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.9 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25.18 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  30.83 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.9 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  33.58 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  25.53 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.39 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>