More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0197 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 346 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  58.54 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  54.95 
 
 		 323 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  53.85 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  48.57 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  48.57 
 
 		 316 aa  308  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  47.42 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  43.77 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  46.23 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.6 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  43.95 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  37.17 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  39.67 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  36.54 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  39.34 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 		 312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  39.47 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  38.19 
 
 		 314 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  35.57 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  35.33 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  35.23 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.03 
 
 		 312 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  34.56 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  35.23 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  34.5 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  34.5 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  34.5 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  34.5 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  40.66 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  33.87 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  36.45 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  35.88 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  36.22 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  33.86 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  33.99 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  33.54 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  33.23 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  32.92 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  35.62 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  32.92 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  32.92 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  32.92 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  32.71 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  32.71 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  34.97 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  35.06 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  35.71 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.87 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  33.89 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  33.89 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  33.89 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  36.95 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  36.81 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  34.06 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  36.93 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  36.6 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  32.17 
 
 		 324 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  36.36 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  38.52 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  33.22 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  35 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  33.13 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  36.04 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  36.04 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.29 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  36.04 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  36.16 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  34.55 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  35.83 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  36 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  34.92 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  33.01 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  33.77 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  29.34 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.27 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  35.35 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  32.23 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  32.23 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  32.23 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  32.23 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.44 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  33.56 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  34.92 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  33.56 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  36.09 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  30.63 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  32 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>