More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00029 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00029  chemotaxis protein  100 
 
 
340 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.377111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1855  CheW protein  78.32 
 
 
429 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0150671  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30.34 
 
 
165 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30.34 
 
 
165 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.59 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.33 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.85 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.28 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.85 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.23 
 
 
159 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.39 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  32.82 
 
 
136 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.29 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.33 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.56 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.17 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30.87 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  34.07 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  34.07 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.37 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  34.07 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  33.82 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  29.25 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  33.82 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.11 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.11 
 
 
161 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  30.41 
 
 
185 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.29 
 
 
159 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 
159 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.29 
 
 
159 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.29 
 
 
159 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.29 
 
 
159 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  34.07 
 
 
165 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 
167 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  33.09 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  33.09 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  33.09 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  33.09 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  33.09 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.29 
 
 
159 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.47 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.37 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.78 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.36 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.38 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  28.15 
 
 
158 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  29.93 
 
 
162 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  33.59 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  31.54 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.93 
 
 
162 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  35.29 
 
 
158 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  29.46 
 
 
158 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  32.41 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.5 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.79 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  27.15 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  31.62 
 
 
167 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.85 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.85 
 
 
164 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  32.41 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.99 
 
 
155 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  31.25 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.76 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  33.1 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.11 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.68 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  32 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.78 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  28.15 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  31.62 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.85 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.12 
 
 
184 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.37 
 
 
168 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.89 
 
 
163 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  36.61 
 
 
140 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.22 
 
 
164 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  34.02 
 
 
155 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  25.95 
 
 
164 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25.34 
 
 
170 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>