More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3332 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  95.09 
 
 		 326 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 326 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  100 
 
 		 326 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  100 
 
 		 326 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  100 
 
 		 326 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  85.58 
 
 		 326 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  85.19 
 
 		 324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  74.21 
 
 		 326 aa  500  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  72.64 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  73.27 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  41.03 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  40.38 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  35.98 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  40.37 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.36 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  40.25 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  38.89 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  39.63 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  40.37 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  39.63 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  37.78 
 
 		 316 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.32 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.01 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  40.18 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  40.06 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.58 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  34.5 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.29 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  36.42 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  32.28 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  36.45 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  35.09 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  35.09 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  34.18 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  34.78 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  34.78 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  34.78 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  33.86 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  33.86 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  33.23 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  35.03 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  32.59 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  32.92 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  33.13 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.21 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  32.37 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  32.69 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  31.62 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  32.24 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  31.62 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  30.82 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.3 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  34.17 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  29.49 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.42 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  32.09 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  33.78 
 
 		 308 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  32.8 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  32.8 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  34.56 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  32.89 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  29.7 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  33.11 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  28.34 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33.78 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  32.17 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  31.85 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  33.11 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  33.67 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  31.85 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  31.83 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  29.8 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  31.85 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  32.48 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  32.15 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  31.53 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  33.44 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  32.11 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  32.58 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.46 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  31.94 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  32.47 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  32.15 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  30.46 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  31.89 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  30.67 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  30.67 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  31.13 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  31.99 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  31.13 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  31.13 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  30.67 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  31.13 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  31 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  30.19 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>