31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3593 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3593  CheW protein  100 
 
 		 521 aa  1006    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  27.48 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2215  CheW-like protein  22.14 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2442  CheW domain protein  23 
 
 		 487 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  21.75 
 
 		 528 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  24.95 
 
 		 568 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  20.68 
 
 		 518 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0056  CheW protein  35.37 
 
 		 162 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  25.58 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  31.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  22.29 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  31.71 
 
 		 161 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  31.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  39.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  26.85 
 
 		 184 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  28.57 
 
 		 203 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  37.04 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  35.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  34.23 
 
 		 212 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  35.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  37.29 
 
 		 137 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  35.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  28.49 
 
 		 171 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.93 
 
 		 173 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  28.49 
 
 		 171 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.93 
 
 		 173 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.93 
 
 		 173 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  24.55 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  28.44 
 
 		 155 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  29.52 
 
 		 179 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  27.75 
 
 		 184 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>