More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2918 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2918  CheW protein  100 
 
 
301 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00571645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2826  CheW protein  89.77 
 
 
302 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0351832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2734  CheW protein  93.67 
 
 
158 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0273255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  39.01 
 
 
253 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.96 
 
 
162 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  33.81 
 
 
163 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  37.7 
 
 
158 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.7 
 
 
158 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.7 
 
 
158 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.96 
 
 
158 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  35.34 
 
 
168 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  40.46 
 
 
166 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.21 
 
 
163 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40 
 
 
165 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.89 
 
 
164 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  28.33 
 
 
262 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  40.71 
 
 
164 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.31 
 
 
161 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.31 
 
 
168 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 
164 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.78 
 
 
159 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  35.34 
 
 
164 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  35.06 
 
 
166 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.56 
 
 
164 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.4 
 
 
167 aa  92.8  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.56 
 
 
163 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.38 
 
 
161 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  31.79 
 
 
171 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.64 
 
 
165 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.64 
 
 
165 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.9 
 
 
161 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.4 
 
 
159 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.11 
 
 
147 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  37.4 
 
 
159 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.77 
 
 
159 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  30.94 
 
 
164 aa  89  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.34 
 
 
165 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 
165 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  35 
 
 
166 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  37.59 
 
 
531 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.06 
 
 
159 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  38.52 
 
 
163 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.64 
 
 
159 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.88 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.38 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.38 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.64 
 
 
159 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.38 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.24 
 
 
157 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  37.96 
 
 
156 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.11 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.38 
 
 
159 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.56 
 
 
163 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 
164 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  38.24 
 
 
163 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  34.62 
 
 
169 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.82 
 
 
518 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 
164 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.46 
 
 
160 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 
164 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.07 
 
 
164 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.07 
 
 
164 aa  85.5  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.81 
 
 
161 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.81 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  37.12 
 
 
159 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.09 
 
 
163 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.37 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.61 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.46 
 
 
165 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  32.69 
 
 
174 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.12 
 
 
167 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.85 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  38.46 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  34.88 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  29.01 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.85 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.29 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  35.94 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.64 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.85 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.66 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  25.55 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.81 
 
 
163 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.46 
 
 
149 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  37.1 
 
 
159 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  39.44 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  35.71 
 
 
149 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.58 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.57 
 
 
162 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  34.06 
 
 
161 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>