More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2084 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
336 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  71.9 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  71.87 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  69.67 
 
 
318 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  50.74 
 
 
320 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  51.6 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  50.45 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  51.06 
 
 
312 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  51.83 
 
 
318 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  44.44 
 
 
390 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  48.08 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  43.77 
 
 
346 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  41.74 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  35.98 
 
 
326 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  35.98 
 
 
326 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  35.98 
 
 
326 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  35.98 
 
 
326 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  36.2 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  42.5 
 
 
301 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  36.59 
 
 
326 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  36 
 
 
326 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  35.69 
 
 
342 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  35.98 
 
 
326 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  41.72 
 
 
313 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 
324 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.03 
 
 
312 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  40.8 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  41.64 
 
 
312 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  42.72 
 
 
308 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.21 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  39.02 
 
 
316 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  38.18 
 
 
314 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  38.08 
 
 
302 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  37.54 
 
 
302 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  37.54 
 
 
302 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  37.23 
 
 
302 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  37.23 
 
 
302 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.54 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  37.23 
 
 
302 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  37.23 
 
 
302 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  37.23 
 
 
302 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  36.42 
 
 
302 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  35.69 
 
 
301 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  35.47 
 
 
324 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  34.63 
 
 
317 aa  182  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  33.73 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  33.65 
 
 
311 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  33.73 
 
 
318 aa  169  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  33.33 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  31.64 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  31.64 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.43 
 
 
322 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  31.64 
 
 
318 aa  165  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.64 
 
 
313 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  30.79 
 
 
346 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 
317 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.96 
 
 
310 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  35.87 
 
 
312 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  31.17 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  30.9 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  33.45 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.63 
 
 
309 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  31.14 
 
 
316 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  31.14 
 
 
316 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  32.06 
 
 
313 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  33.21 
 
 
325 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  31.65 
 
 
334 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  31.65 
 
 
334 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  31.91 
 
 
333 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  31.91 
 
 
333 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  32.04 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  33.45 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  32.16 
 
 
310 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  31.91 
 
 
311 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  31.34 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  31.69 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  33.1 
 
 
309 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  31.31 
 
 
334 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  33.1 
 
 
309 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  32.84 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  32.13 
 
 
309 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  32.51 
 
 
308 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  32.51 
 
 
308 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  30.63 
 
 
319 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.79 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  30.53 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  32.73 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  32.14 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  31.72 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  31.72 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  31.73 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  33.21 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  31.72 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  35.66 
 
 
311 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  31.77 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  31.05 
 
 
330 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.09 
 
 
320 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  29.81 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  31.72 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  32.34 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>