More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1855 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1855  CheW protein  100 
 
 		 429 aa  827    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0150671  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00029  chemotaxis protein  78.32 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.377111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.19 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.19 
 
 		 165 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.53 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.04 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.92 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  32.73 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  32.21 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  35.71 
 
 		 136 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.85 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  32.81 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.58 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.41 
 
 		 174 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  32.17 
 
 		 154 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.85 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.85 
 
 		 164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 164 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.01 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  28.17 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30.71 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.93 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  29.5 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  28.17 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.72 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  30.66 
 
 		 161 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  33.14 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  32.41 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.03 
 
 		 139 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.09 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31.21 
 
 		 161 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.87 
 
 		 164 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  32.41 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  34 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.39 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  33.79 
 
 		 162 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.39 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.13 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  31.33 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  28.86 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  32.12 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  30.08 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  30 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  31.69 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  29.41 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.19 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.86 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  29.25 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.79 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.82 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.93 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  32.65 
 
 		 166 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.93 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  30.88 
 
 		 164 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 165 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.16 
 
 		 174 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.77 
 
 		 164 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  28.9 
 
 		 177 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  26.58 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  28.9 
 
 		 177 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.93 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.93 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  30.32 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  30.77 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.36 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  31.16 
 
 		 174 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  30.32 
 
 		 165 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  30.32 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.93 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  31.62 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  29.69 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.35 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.7 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.05 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>