26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01609 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  72.73 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  67.53 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  69.86 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  31.11 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.01 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  33.81 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  31.25 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  31.88 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  30.56 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  26.06 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  31.88 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  32.32 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  33.56 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  33.56 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  32.88 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  26.21 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  21.33 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1760  CheW protein  25.77 
 
 		 875 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  31.63 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0993  CheW protein  30.77 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165537  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4065  CheW protein  46.81 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  32.53 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3537  putative CheW protein  29.82 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>