217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3257 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3257  CheW protein  100 
 
 		 163 aa  312  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  35.17 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2188  CheW protein  30.82 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2031  CheW protein  30.82 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.505139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  30.2 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.88 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.01 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  32.64 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.47 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  33.09 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  35.04 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.37 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  25.36 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  31.69 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  23.91 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.27 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  31.69 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  31.69 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26.35 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.46 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.63 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  23.19 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  25.85 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  28.28 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0993  CheW protein  25.71 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165537  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  26.09 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  26.87 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  25.4 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  28.46 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  26.71 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  30.39 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  26.92 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  27.85 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  25.76 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  25 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  23.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.36 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  31.43 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  32.69 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  28.28 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.64 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  26.03 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  28.66 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  29.06 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  29.55 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.36 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  22.38 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.43 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  27.41 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  27.86 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.74 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  24.64 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  22.38 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.64 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  28.47 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  24.44 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  23.91 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  23.31 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.08 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  23.88 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  23.29 
 
 		 518 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  23.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  24.83 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.64 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  24.07 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  27.35 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.47 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  26.72 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  26.28 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  30.48 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  26.09 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  25.47 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  30.48 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.91 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  21.9 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  22.06 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  23.19 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  27.93 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  29.41 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.38 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  22.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  25.74 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  25 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.93 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5116  putative CheW protein  29.2 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  0.0201164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>