290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5116 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5116  putative CheW protein  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  0.0201164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  38.12 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  24.2 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.1 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.79 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  29 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  38.03 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  26.09 
 
 		 344 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.81 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0329  CheW protein  34.29 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3255  CheW protein  28.3 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0912873  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  27.5 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  31 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  23.73 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.14 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.29 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  28.57 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  33.04 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.81 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  31.68 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  27.86 
 
 		 146 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  27.54 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  30.56 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  36.36 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.8 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.8 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.2 
 
 		 165 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.54 
 
 		 163 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  24.84 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  27.78 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.32 
 
 		 163 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  29.8 
 
 		 149 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  40.68 
 
 		 156 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.82 
 
 		 161 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  35.56 
 
 		 301 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  34.67 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  26.09 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  40.82 
 
 		 333 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  24.66 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  28.16 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.85 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  26.04 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.01 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  35.16 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.95 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  30.36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 164 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  36.62 
 
 		 158 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  30.99 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  28.76 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.13 
 
 		 159 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  34 
 
 		 163 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.43 
 
 		 146 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  29.76 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  32.18 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.52 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.14 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  24.06 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.52 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.52 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  26.47 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.52 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.35 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  31.43 
 
 		 154 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.93 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.32 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.36 
 
 		 159 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  28.09 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  32.2 
 
 		 147 aa  48.5  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  30.37 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  32.2 
 
 		 147 aa  48.5  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.7 
 
 		 169 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.33 
 
 		 907 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  34.33 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  39.06 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.86 
 
 		 159 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  36 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  37.5 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  38 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.63 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.14 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  37.88 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.13 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  33.9 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  35.59 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  32.94 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.45 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.71 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  27.73 
 
 		 779 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  25.86 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  36.11 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  28.24 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  32.39 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>