More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1843 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  316  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  30 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  33.04 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  31.97 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  40.21 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.57 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.56 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  37.5 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  29.79 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  36.78 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.3 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  39.02 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  37.5 
 
 		 528 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  32.29 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  28.21 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.2 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  35.23 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  31.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.69 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  35.23 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  36.73 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  25.25 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5116  putative CheW protein  33.04 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  0.0201164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  28.36 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  27.69 
 
 		 365 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  32.08 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  30.58 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  34.29 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  27.05 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  29.8 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.08 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  27.35 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  36.76 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  32.94 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  42.11 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  38.46 
 
 		 907 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  27.61 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.87 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  39.29 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  25.52 
 
 		 331 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  30.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.87 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  35.8 
 
 		 275 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  27.62 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  33.82 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  33.82 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  33.82 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.68 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.21 
 
 		 478 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0610  CheW protein  34.03 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.35 
 
 		 518 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.82 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2371  putative CheW protein  37.5 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.09 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  34.83 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.26 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.63 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  33.82 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.06 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.57 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  27.35 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.26 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0644  CheW protein  34.03 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.35775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  38.89 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0635  CheW protein  33.1 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.12 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.25 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  27.08 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  30.34 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  33.82 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0030  chemotaxis signal transduction protein  39.78 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.42 
 
 		 324 aa  50.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.77 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.88 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.71 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.42 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  36 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.13 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  25.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  32.22 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  25.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  27.59 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.12 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  25.84 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.89 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  40 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  36 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  35.71 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.68 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  28.57 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30.83 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  33.8 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  40 
 
 		 779 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  33.82 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.84 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>