More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1071 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3577  CheW protein  50.6 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3204  CheW protein  40.61 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.97 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  29.11 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.26 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  32.08 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  31.37 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.06 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.7 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.88 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.85 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.63 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  32.61 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.48 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.76 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.27 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  28.39 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  29.68 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.27 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  31.41 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  29.75 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  29.52 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.67 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.67 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.1 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.09 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.06 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  32.34 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  27.74 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  29.03 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.06 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.06 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.33 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.06 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  29.34 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.38 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.28 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.3 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  24.86 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.98 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.3 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.06 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.88 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.01 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  32.05 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.98 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.27 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  31.74 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.98 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.38 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  29.03 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.22 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.27 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  26.99 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.22 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  32.61 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.77 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.45 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.45 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.45 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.45 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.48 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.45 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.48 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  29.68 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.3 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  26.97 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.22 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  26.58 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.41 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  26.79 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  26.79 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.09 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.74 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  31.25 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  25.3 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  25.3 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  25.64 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.67 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  28.14 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  31.54 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  28.39 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  27.27 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  24.1 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  28.29 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>