More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3204 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3204  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  336  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3577  CheW protein  46.71 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  40.61 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  33.33 
 
 		 147 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.1 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.76 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.11 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.79 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.79 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  30.26 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.75 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.46 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.11 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  29.53 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.63 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  34.23 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.38 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.26 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.61 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.63 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.63 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  27.95 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.93 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.63 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.2 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  25.61 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.95 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.12 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.08 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31.08 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.73 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  28.95 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.63 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.12 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  26.62 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.8 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  29.61 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.5 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.7 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.14 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  29.75 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  28.93 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  35.16 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  29.05 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.03 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.03 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.67 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  28.3 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.95 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  29.25 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  29.25 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  24.36 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.66 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  26.95 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  26.95 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.66 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.61 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.97 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  26.14 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  28.89 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  26.14 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  29.93 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  26.14 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.97 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  29.75 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  26.14 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.15 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.8 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  30.32 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  27.88 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  31.29 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  26.8 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  27.7 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  29.68 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  26.42 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.22 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  28 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  32.89 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  27.7 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  32.45 
 
 		 238 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  29.87 
 
 		 331 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.53 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  28.19 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  28.19 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>