More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3577 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3577  CheW protein  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1071  CheW protein  50.6 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3204  CheW protein  46.71 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.9 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  33.33 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  33.33 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  29.09 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32.64 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.94 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  28.83 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.06 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  28.22 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.08 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.19 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  28.83 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  28.48 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  27.54 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.16 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  27.44 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  24.38 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.48 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.44 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.57 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  29.19 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  27.81 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.09 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.09 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  25.15 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.14 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.48 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  29.38 
 
 		 253 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  28.65 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  25.15 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  25.77 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  33.54 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.14 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  30.06 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  28.16 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.88 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  26.06 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  26.99 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.14 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  28.57 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  26.67 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.14 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  27.95 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  30.36 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.06 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  27.27 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  26.54 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  25.47 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.27 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  30.56 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.06 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  24.55 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.06 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  28.57 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.74 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  26.71 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.71 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.71 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  25.75 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  26.06 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  29.38 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  32.1 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  29.01 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  30.25 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  23.64 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  29.52 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  29.01 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.78 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  25.88 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  25.61 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  29.94 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  30.32 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  24.85 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>