81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3152 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3152  CheW protein  100 
 
 
273 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.168421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0961  CheW protein  43.75 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  35.04 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  37.25 
 
 
141 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.33 
 
 
161 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  26.76 
 
 
189 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  29.81 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  27.7 
 
 
169 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  33.02 
 
 
147 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  33.02 
 
 
147 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  31.3 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.81 
 
 
181 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  25.19 
 
 
515 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  33.64 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  32.5 
 
 
533 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  31.03 
 
 
179 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  31.25 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  25.87 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  28.91 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  32.82 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  35.71 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.68 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.06 
 
 
159 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  35 
 
 
169 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.89 
 
 
907 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  29.17 
 
 
178 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  31.67 
 
 
149 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  36.92 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 
165 aa  46.6  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  25.89 
 
 
179 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  29.11 
 
 
158 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  30 
 
 
161 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  30.19 
 
 
146 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.18 
 
 
159 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  27.07 
 
 
146 aa  45.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  40.35 
 
 
184 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  28.97 
 
 
190 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.28 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  25.33 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  29.17 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  25.58 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  30.77 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  29.91 
 
 
174 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  37.18 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  29.35 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.39 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  31.91 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  26.79 
 
 
520 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.8 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  28.16 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  26 
 
 
479 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.03 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  29.32 
 
 
182 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  31.4 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  38.89 
 
 
146 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  28.85 
 
 
163 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  36.21 
 
 
518 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  32.31 
 
 
172 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  27.03 
 
 
158 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  32.43 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.09 
 
 
165 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  47.17 
 
 
154 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.38 
 
 
158 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  26.26 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  27.83 
 
 
178 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  33.33 
 
 
174 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  27.62 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  27.52 
 
 
531 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  27.62 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  31.65 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  26.02 
 
 
177 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  25.21 
 
 
262 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  27.62 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  40 
 
 
137 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  25.49 
 
 
163 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  30.63 
 
 
161 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  35.16 
 
 
425 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  40 
 
 
137 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  31.08 
 
 
194 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  40 
 
 
137 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>