204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0961 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0961  CheW protein  100 
 
 
268 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3152  CheW protein  43.75 
 
 
273 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.168421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  37.04 
 
 
404 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  37.18 
 
 
531 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  39.74 
 
 
533 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.25 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  30.97 
 
 
520 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  27.89 
 
 
515 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  36.36 
 
 
148 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  37.23 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  33 
 
 
169 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  34.78 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  31.82 
 
 
479 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  32.04 
 
 
190 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  30.4 
 
 
161 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  34.62 
 
 
161 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.58 
 
 
183 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  33.33 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.01 
 
 
160 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.83 
 
 
164 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.9 
 
 
147 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  31.19 
 
 
177 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  37.25 
 
 
425 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  29.63 
 
 
200 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  32.41 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  35.11 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  29.55 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  29.81 
 
 
171 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.81 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.81 
 
 
159 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28 
 
 
170 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  29.41 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  33.33 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  33.05 
 
 
160 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  32.76 
 
 
478 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.87 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  46.3 
 
 
137 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.87 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  31.96 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.87 
 
 
173 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.91 
 
 
164 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  46.3 
 
 
137 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  46.3 
 
 
137 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.4 
 
 
164 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.2 
 
 
181 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  31.18 
 
 
201 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  30.7 
 
 
178 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.71 
 
 
168 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  33.33 
 
 
158 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  31.73 
 
 
568 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  27.73 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  30.67 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.19 
 
 
159 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.91 
 
 
518 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  32.98 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  23.53 
 
 
907 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  31.58 
 
 
184 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  34.29 
 
 
170 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.09 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.09 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.64 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  24.24 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  32.14 
 
 
528 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  31.43 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  27.34 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  34.62 
 
 
137 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  28.97 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  29.2 
 
 
185 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.4 
 
 
159 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  31.15 
 
 
154 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  32 
 
 
158 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  32.69 
 
 
191 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  34.25 
 
 
179 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  30.99 
 
 
192 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.09 
 
 
158 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  32.39 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  26.98 
 
 
176 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  30.7 
 
 
178 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.33 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  32.38 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.33 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  30.6 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  30.99 
 
 
194 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  31.73 
 
 
146 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  34.25 
 
 
333 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  26.92 
 
 
165 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  27.18 
 
 
139 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.71 
 
 
165 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.48 
 
 
141 aa  45.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  30.19 
 
 
141 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  30.56 
 
 
151 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.24 
 
 
141 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  43.86 
 
 
308 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  29.81 
 
 
166 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  35.59 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  38.33 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.67 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  32.81 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>