84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4128 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
651 aa  1345    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  43.22 
 
 
318 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  38.82 
 
 
340 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  34.38 
 
 
393 aa  208  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  38.49 
 
 
347 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  34.39 
 
 
449 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  32.18 
 
 
373 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  31.87 
 
 
381 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  36.48 
 
 
356 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  40.98 
 
 
297 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  37.98 
 
 
380 aa  162  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  29.29 
 
 
551 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  28.57 
 
 
515 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  37.19 
 
 
320 aa  150  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.12 
 
 
906 aa  147  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  39.18 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  28.41 
 
 
409 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  30.38 
 
 
404 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  32.9 
 
 
696 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  29.76 
 
 
307 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  29.62 
 
 
331 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  33.19 
 
 
316 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4141  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 
782 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  25.23 
 
 
337 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  37.42 
 
 
461 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.18 
 
 
491 aa  97.4  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  22.93 
 
 
583 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4264  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.28 
 
 
636 aa  97.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00811307  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2247  hypothetical protein  29.46 
 
 
608 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2302  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
561 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0496203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  37.67 
 
 
260 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  33.33 
 
 
507 aa  93.6  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  22.61 
 
 
431 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
433 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  23.65 
 
 
665 aa  90.9  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  25.64 
 
 
453 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  20.78 
 
 
512 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  26.95 
 
 
1023 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6706  hypothetical protein  28.74 
 
 
488 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58989  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3654  hypothetical protein  29.92 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1143 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.64 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  35.51 
 
 
158 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  25.83 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  24.81 
 
 
636 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  29.3 
 
 
639 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
1075 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.62 
 
 
850 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  24.07 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  23.62 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  38.3 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  29.03 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  38.37 
 
 
89 aa  63.9  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  30.57 
 
 
414 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  26.97 
 
 
564 aa  60.1  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  27.64 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  34.78 
 
 
107 aa  57.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  24.88 
 
 
554 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  29.67 
 
 
209 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  23.61 
 
 
904 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
610 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  28.31 
 
 
340 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
585 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 
596 aa  47.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 
641 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
570 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
621 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
861 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3647  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
480 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  37.11 
 
 
591 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
862 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
340 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.78 
 
 
551 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2336  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
414 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
338 aa  45.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2285  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
414 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
338 aa  45.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
543 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
877 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
519 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
519 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>