51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4415 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.62 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  31.39 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  28.62 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  25.84 
 
 
340 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.09 
 
 
906 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  27.21 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  29.62 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  28.77 
 
 
373 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  27.01 
 
 
393 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  28.16 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  27.12 
 
 
404 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
651 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  27.41 
 
 
307 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.54 
 
 
512 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  31.11 
 
 
696 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  26.74 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  27.51 
 
 
551 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  26.34 
 
 
419 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  28.09 
 
 
409 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  25.85 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  30.08 
 
 
1023 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  28.34 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  22.54 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  22.08 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  29.19 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.86 
 
 
665 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  43.01 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  28.36 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  20.19 
 
 
583 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.86 
 
 
850 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  21.22 
 
 
636 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  28.57 
 
 
507 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  22.48 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  31.14 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
636 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
433 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
1143 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  34.88 
 
 
89 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  25.67 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  45.1 
 
 
107 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  20.35 
 
 
639 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  29.52 
 
 
564 aa  47  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  25.23 
 
 
461 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  22.7 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
1075 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  27.21 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  26.26 
 
 
904 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  22.89 
 
 
426 aa  43.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  21.76 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.532937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>