61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2057 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  40.9 
 
 
347 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  37.78 
 
 
449 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  40.79 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  33.33 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  30.57 
 
 
381 aa  195  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  34.47 
 
 
340 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  38.18 
 
 
393 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
651 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  32.62 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  41.15 
 
 
297 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  38.36 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  36.01 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.58 
 
 
906 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  31.31 
 
 
696 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  31.02 
 
 
551 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  26.37 
 
 
515 aa  139  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  31.3 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  32.47 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  32.84 
 
 
307 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  29.62 
 
 
337 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.68 
 
 
491 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  31.77 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  32.13 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  31.75 
 
 
1023 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  26.56 
 
 
512 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  25.62 
 
 
453 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
1075 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
1143 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  35.51 
 
 
260 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  25.65 
 
 
583 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  36.07 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  31.58 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  38.78 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  26.62 
 
 
665 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  25.25 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  33.08 
 
 
158 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  39.53 
 
 
89 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  42.7 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  29.27 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  24.78 
 
 
636 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  27.19 
 
 
554 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 
636 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  42.17 
 
 
107 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  28.23 
 
 
209 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  29.29 
 
 
522 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  27.1 
 
 
564 aa  62.4  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  49.06 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  28.83 
 
 
235 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  24.18 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  42.37 
 
 
385 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  40 
 
 
392 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  23.49 
 
 
568 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0722  KWG repeat protein  38.55 
 
 
102 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.69904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  23.71 
 
 
565 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
850 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  32.1 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  28.99 
 
 
904 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2387  KWG repeat protein  42.86 
 
 
68 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000779231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1724  hypothetical protein  26.61 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.189093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>