19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2387 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2387  KWG repeat protein  100 
 
 		 68 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000779231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.81 
 
 		 850 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  35.59 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  44.07 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  40.43 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  33.9 
 
 		 449 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  38.89 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  58.33 
 
 		 551 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  30.51 
 
 		 340 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  50 
 
 		 373 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  37.78 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  40.43 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  41.67 
 
 		 639 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  36.92 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  36.96 
 
 		 512 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  38.6 
 
 		 381 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  32.79 
 
 		 696 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  34.04 
 
 		 515 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>