57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1108 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  811    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  30.79 
 
 
381 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  34.55 
 
 
449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  28.99 
 
 
373 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  30.25 
 
 
347 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  31.74 
 
 
318 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  27.46 
 
 
340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
651 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  28.06 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  30.64 
 
 
393 aa  133  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  32.47 
 
 
356 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  28.3 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  29.28 
 
 
696 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  26.32 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  25.26 
 
 
515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  30.94 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  26.65 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.5 
 
 
906 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  25.62 
 
 
307 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.34 
 
 
331 aa  99.8  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  27.78 
 
 
665 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  30 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.56 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  32.86 
 
 
639 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  30.97 
 
 
636 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  28.09 
 
 
337 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  33.83 
 
 
260 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  31.47 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  26.57 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  27.16 
 
 
1023 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1075 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  33.06 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  26.92 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  30.97 
 
 
158 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
1143 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.7 
 
 
636 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  27.4 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  29.53 
 
 
507 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  26.54 
 
 
316 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  29.92 
 
 
181 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 
850 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  36.59 
 
 
89 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  37.37 
 
 
522 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  33.14 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  28.57 
 
 
209 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  22.67 
 
 
554 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  25.93 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  43.1 
 
 
107 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  22.22 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  24.11 
 
 
564 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  22.26 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  22.61 
 
 
904 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  21.62 
 
 
565 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>