50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1612 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1193    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  27.95 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  25.38 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.57 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  23.05 
 
 		 340 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  26.64 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  24.19 
 
 		 696 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.52 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  25.62 
 
 		 381 aa  102  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  24.57 
 
 		 551 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  22.93 
 
 		 651 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  24.47 
 
 		 307 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  23.53 
 
 		 318 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.48 
 
 		 906 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  27.05 
 
 		 419 aa  92  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  24.44 
 
 		 356 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  27.46 
 
 		 665 aa  87.8  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  22.16 
 
 		 404 aa  87.4  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  26.57 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  23.38 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  29.38 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  23.63 
 
 		 331 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  21.66 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.72 
 
 		 850 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  20.19 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.07 
 
 		 636 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  21.71 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  22.04 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  21.43 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  21.62 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  22.87 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  20.91 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1075 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1023 aa  60.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1143 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  26.43 
 
 		 316 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  28.23 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  22.15 
 
 		 904 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  27.89 
 
 		 235 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  23.48 
 
 		 260 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  22.05 
 
 		 431 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  27.71 
 
 		 89 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  29.24 
 
 		 209 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  46.67 
 
 		 107 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  27.54 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4076  hypothetical protein  26.47 
 
 		 269 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  21.2 
 
 		 426 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  26 
 
 		 181 aa  43.9  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  24.02 
 
 		 414 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>