45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0482 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  100 
 
 		 453 aa  932    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  29.46 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  29.21 
 
 		 696 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.9 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  25.62 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  27.2 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  29.5 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 651 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  25.62 
 
 		 373 aa  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  27.76 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  25 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.51 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  28.34 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  21.49 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  33.62 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.08 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  23 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  21.62 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  33.02 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  28.91 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  31.73 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  22.93 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  25.57 
 
 		 512 aa  57  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  26.78 
 
 		 320 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  25.93 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  30.39 
 
 		 181 aa  54.7  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  28.22 
 
 		 209 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  27.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  23.72 
 
 		 665 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.46 
 
 		 850 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  25.6 
 
 		 260 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.37 
 
 		 636 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  24.57 
 
 		 636 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1023 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.35 
 
 		 235 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  19.75 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  25.35 
 
 		 639 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  34.44 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  32.14 
 
 		 89 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1075 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  36.71 
 
 		 107 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  25.2 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>