58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2188 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  795    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 651 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  34.74 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  34.13 
 
 		 449 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  38.18 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  36.46 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  31.82 
 
 		 373 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  32.89 
 
 		 340 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  32.97 
 
 		 380 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  31.9 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  36.64 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  30.64 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  31.41 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  24.35 
 
 		 515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  30.45 
 
 		 419 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.82 
 
 		 906 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  24.38 
 
 		 583 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  30.03 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  28.53 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  26.12 
 
 		 696 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  27.01 
 
 		 337 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  25.75 
 
 		 512 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  32.17 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  26.64 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  29.5 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1023 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  40.65 
 
 		 507 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  27.65 
 
 		 235 aa  89.4  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  35.76 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1143 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  28.05 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  32.61 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  25.18 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.66 
 
 		 850 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  26.64 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1075 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  34.38 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  39.18 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.18 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  24.91 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  34.86 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  23.96 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  26.53 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  27.59 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  32.95 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  22.35 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  24.71 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  36.78 
 
 		 107 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  23.04 
 
 		 904 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  27.41 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  33.06 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1650  hypothetical protein  20.13 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0722  KWG repeat protein  34.83 
 
 		 102 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.69904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1932  hypothetical protein  20.13 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0326213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>