19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1031 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 904 aa  1855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  22 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.74 
 
 		 906 aa  54.7  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  22.15 
 
 		 583 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  21.75 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  23.04 
 
 		 393 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 		 651 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  36.92 
 
 		 507 aa  48.5  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  26.29 
 
 		 320 aa  48.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  33.77 
 
 		 347 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.62 
 
 		 107 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1023 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.55 
 
 		 636 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  22.88 
 
 		 551 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 318 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3764  hypothetical protein  21.69 
 
 		 393 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  27.01 
 
 		 414 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  22.78 
 
 		 409 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>