25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6384 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  100 
 
 		 414 aa  841    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  33.14 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.55 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  22.48 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  25.27 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  26.92 
 
 		 696 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  24.17 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  45.16 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.76 
 
 		 906 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.6 
 
 		 636 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  25.11 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  33.73 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  25 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  24.8 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  25.35 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  33.82 
 
 		 107 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  27.91 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  32.1 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  27.01 
 
 		 904 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  24.02 
 
 		 583 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  33.33 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  31.17 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  33.96 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>