56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0788 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  32.02 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  29.84 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  34.25 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  29.18 
 
 		 696 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  34.45 
 
 		 380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 		 651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  30.86 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  32.13 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  29.45 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  29.58 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  27.63 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.34 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.34 
 
 		 491 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  26.64 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  25.16 
 
 		 419 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  29.35 
 
 		 320 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.35 
 
 		 515 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  30.43 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.23 
 
 		 906 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  26.84 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  24.04 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  27.3 
 
 		 665 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  27.34 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  27.67 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  23.63 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1023 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1143 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  28.7 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  35.97 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  37.5 
 
 		 507 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  28.36 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1075 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  23.64 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.17 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  48.1 
 
 		 107 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  24.72 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.66 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  31.87 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  22.12 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  29.8 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  26.19 
 
 		 564 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  27.17 
 
 		 235 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  23.32 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  44.44 
 
 		 89 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  30.65 
 
 		 158 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.7 
 
 		 850 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  22.16 
 
 		 554 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  37.1 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  30.83 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  21.64 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  22.91 
 
 		 426 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  31.17 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2891  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.43 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>