50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0838 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  24.81 
 
 		 340 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  27.65 
 
 		 393 aa  89.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  28.57 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  25.71 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.47 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  27.57 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  26.19 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  28.29 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  29.19 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.57 
 
 		 906 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  26.26 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  31.96 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.88 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  29.95 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  25.35 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  26.57 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  26.79 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1023 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  25.26 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  28.83 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.23 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  22.69 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.12 
 
 		 636 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 431 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.37 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  39.34 
 
 		 491 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  24.31 
 
 		 380 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 433 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  27.89 
 
 		 583 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  28.43 
 
 		 639 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  28.57 
 
 		 512 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  38.37 
 
 		 89 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4076  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  30 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  33.72 
 
 		 461 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  22.7 
 
 		 636 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  27.71 
 
 		 507 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  26.35 
 
 		 453 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1143 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  41.51 
 
 		 392 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1075 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  26.37 
 
 		 327 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  30.95 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0722  KWG repeat protein  37.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.69904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  29.48 
 
 		 209 aa  42  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>