52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01890 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  100 
 
 		 1023 aa  2077    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  29.04 
 
 		 449 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.83 
 
 		 906 aa  118  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  31.75 
 
 		 356 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  26.33 
 
 		 318 aa  99.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  26.24 
 
 		 381 aa  97.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  27.02 
 
 		 347 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  26.56 
 
 		 551 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  25.46 
 
 		 393 aa  90.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 651 aa  90.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  34.51 
 
 		 340 aa  89.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  27.04 
 
 		 320 aa  87.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.37 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  25 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  30.08 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  38.69 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  24.04 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.16 
 
 		 409 aa  77.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  27.15 
 
 		 419 aa  73.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  27.52 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  32.14 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  26.28 
 
 		 331 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  37.37 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 431 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  27.85 
 
 		 491 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  33.06 
 
 		 696 aa  67  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  25.39 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  33.86 
 
 		 461 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  29.22 
 
 		 235 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  32.32 
 
 		 583 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1075 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  26.9 
 
 		 665 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  37.08 
 
 		 342 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1143 aa  57.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  33.66 
 
 		 507 aa  55.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  32.46 
 
 		 260 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 89 aa  52.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2396  hypothetical protein  31.39 
 
 		 188 aa  52  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.374113 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  29.37 
 
 		 158 aa  51.6  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  23.81 
 
 		 554 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  36.71 
 
 		 107 aa  49.7  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.61 
 
 		 636 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  30.97 
 
 		 392 aa  49.7  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  29.06 
 
 		 564 aa  49.3  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.27 
 
 		 639 aa  48.9  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 		 850 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  27.27 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  40.3 
 
 		 385 aa  47.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  37.74 
 
 		 904 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  25.66 
 
 		 426 aa  46.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>