45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0331 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 665 aa  1350    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  22.72 
 
 		 696 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  21.31 
 
 		 340 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.78 
 
 		 409 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  23.65 
 
 		 651 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  24.82 
 
 		 449 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.33 
 
 		 347 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  25.12 
 
 		 373 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  27.46 
 
 		 583 aa  87.8  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  20.97 
 
 		 512 aa  87  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.04 
 
 		 906 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  25.18 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  23.56 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.3 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  26.62 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  21.1 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  26.98 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  24.44 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  22.6 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  23.56 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  26.34 
 
 		 316 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  25.35 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  28.12 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  24.86 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  24.82 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  24.46 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  27.52 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  24.05 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  28.68 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.79 
 
 		 235 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.56 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  26.76 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  40.98 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1023 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  41.43 
 
 		 181 aa  55.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  30 
 
 		 89 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.33 
 
 		 850 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  20.92 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  23.72 
 
 		 453 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  25.27 
 
 		 565 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  26.28 
 
 		 568 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  31.25 
 
 		 342 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>