36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0332 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1081    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  26.64 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  26.98 
 
 		 665 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  29.82 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  28.31 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  28.09 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  26.96 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  25.56 
 
 		 340 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  31.78 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  32.35 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  29.29 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  37.37 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  29.05 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  30.36 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  21.49 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  27.1 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  29.93 
 
 		 696 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  31.68 
 
 		 320 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  30.43 
 
 		 342 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  23.49 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  29.29 
 
 		 551 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  23.02 
 
 		 639 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 		 433 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  23.02 
 
 		 636 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  32.88 
 
 		 107 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  27.5 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  23.85 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  25 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  27.54 
 
 		 583 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  28.75 
 
 		 89 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.81 
 
 		 906 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1023 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  25.2 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  23.33 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>