62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0751 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  100 
 
 		 340 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  36.61 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  35.2 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 		 651 aa  215  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  35.88 
 
 		 381 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  34.47 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  30.72 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  35.38 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  33.65 
 
 		 419 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  32.89 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  31.63 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  30.42 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  33.23 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  35.69 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.45 
 
 		 409 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  32.91 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  25.73 
 
 		 696 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.3 
 
 		 906 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  29.84 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  25.84 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32.87 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  20.06 
 
 		 512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  25.63 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  23.05 
 
 		 583 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  31.14 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  21.31 
 
 		 665 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  38.51 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  29.52 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  25.8 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  27.51 
 
 		 235 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1023 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  35.38 
 
 		 158 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  30.22 
 
 		 507 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  43.01 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 1075 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1143 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  21.49 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  39.24 
 
 		 89 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.42 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.96 
 
 		 850 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  27.94 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  25.23 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  31.58 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  25.56 
 
 		 522 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  26.28 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.74 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  27.41 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  29.68 
 
 		 554 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  25.3 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4154  hypothetical protein  27.91 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.148826  normal  0.141947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  25.52 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1031  hypothetical protein  21.75 
 
 		 904 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  24.17 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0722  KWG repeat protein  30.68 
 
 		 102 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.69904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4076  hypothetical protein  24.1 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  21.45 
 
 		 568 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  23.47 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3308  KWG repeat protein  37.25 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2387  KWG repeat protein  30.51 
 
 		 68 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000779231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>