8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3308 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3308  KWG repeat protein  100 
 
 		 512 aa  1016    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  43.75 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  34.72 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 461 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  45.65 
 
 		 107 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  37.25 
 
 		 340 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  30.88 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  37.29 
 
 		 696 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>