39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0435 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  100 
 
 		 431 aa  848    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  25.8 
 
 		 340 aa  96.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  22.61 
 
 		 651 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  24.07 
 
 		 318 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  27.63 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  24.65 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  25.25 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  24.32 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  27.68 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  25.87 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.67 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.51 
 
 		 906 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  26.92 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  23.49 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  20.22 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  28.38 
 
 		 551 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  23.82 
 
 		 696 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  26.18 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  22.89 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1023 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  24.59 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  24.03 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  23.24 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  23.91 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  24.71 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  30.22 
 
 		 235 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  22.62 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1143 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  23.79 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  25.67 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  26.89 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  27.27 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  22.05 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  23.11 
 
 		 461 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  28.46 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.66 
 
 		 636 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  20.82 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  30 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>