193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4268 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 636 aa  1302    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.45 
 
 		 850 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.71 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.48 
 
 		 490 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  28.57 
 
 		 696 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  30.94 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32 
 
 		 1402 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.02 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.03 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1493 aa  77  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  28.17 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  29.37 
 
 		 636 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.82 
 
 		 684 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.49 
 
 		 831 aa  74.3  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  28.99 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  25 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.45 
 
 		 865 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.83 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  25.06 
 
 		 961 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  27.7 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  30.95 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  29.19 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  27.13 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.7 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  29.63 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.87 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.68 
 
 		 318 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  23.74 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.1 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  27.07 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  29.13 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.04 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.13 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  26.9 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.86 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.9 
 
 		 2413 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  28.12 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.2 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.17 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  27.03 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  31.85 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1143 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.2 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  24.8 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  27.16 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.16 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.65 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  24.77 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.16 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  28.64 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.38 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  27.56 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  26.72 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.13 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1877 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.24 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  30.84 
 
 		 1078 aa  58.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.84 
 
 		 1044 aa  58.9  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 		 860 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.17 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 1430 aa  58.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  26.56 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  26.72 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.66 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  25 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.89 
 
 		 552 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1037 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  26 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1075 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.36 
 
 		 789 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.15 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  25.7 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 346 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.39 
 
 		 373 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  20.62 
 
 		 515 aa  55.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  35.77 
 
 		 763 aa  55.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  26.72 
 
 		 325 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  32.63 
 
 		 297 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  30.3 
 
 		 337 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 276 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  28.12 
 
 		 235 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  29.05 
 
 		 228 aa  54.7  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 705 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.5 
 
 		 693 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  29.83 
 
 		 373 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  26.79 
 
 		 415 aa  54.3  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 392 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  26.27 
 
 		 838 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.76 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 252 aa  53.9  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33 
 
 		 193 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  30.65 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 278 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  26.82 
 
 		 961 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>