42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1003 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  100 
 
 		 158 aa  316  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  33.8 
 
 		 696 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  32.59 
 
 		 318 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  38.26 
 
 		 449 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  38.89 
 
 		 419 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  35.38 
 
 		 340 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  33.33 
 
 		 347 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 		 651 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  31.82 
 
 		 404 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 433 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  33.08 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  38.1 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 515 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  36.09 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  34.38 
 
 		 393 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  30.97 
 
 		 409 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34.78 
 
 		 906 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  31.45 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  33.59 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  28.47 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  30.46 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.8 
 
 		 636 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  38.2 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  31.45 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  28.15 
 
 		 507 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  28.36 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  27.35 
 
 		 461 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  30.37 
 
 		 316 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  27.37 
 
 		 453 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  27.66 
 
 		 551 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1023 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  30 
 
 		 89 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  25 
 
 		 639 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  30.65 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  27.54 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  19.85 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  27.21 
 
 		 337 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  34.18 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6384  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 414 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  35.29 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 850 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.78 
 
 		 665 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>