42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4619 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  84.69 
 
 		 639 aa  1028    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1253    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  25 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  30.97 
 
 		 409 aa  90.5  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  21.2 
 
 		 696 aa  87.8  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  25 
 
 		 347 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  31.47 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.63 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  34.62 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 651 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  31.28 
 
 		 381 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 		 636 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  27.67 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  22.78 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  24.07 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  24.78 
 
 		 356 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  19.21 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  26.28 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.33 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  26.26 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  23.96 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  30.06 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  25.57 
 
 		 320 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  21.21 
 
 		 337 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  19.66 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  24.72 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  29.92 
 
 		 260 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  22.73 
 
 		 461 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  26.73 
 
 		 297 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  20.92 
 
 		 665 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  33.85 
 
 		 89 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  23.91 
 
 		 551 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  31.17 
 
 		 181 aa  51.2  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  22.81 
 
 		 850 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  29.11 
 
 		 107 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  23.02 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  24.57 
 
 		 453 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  22.7 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  19.85 
 
 		 158 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  21.05 
 
 		 307 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1023 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>