54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  30.91 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1486  KWG repeat protein  29.83 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0825271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4128  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 651 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  29.52 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  29.62 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2188  hypothetical protein  30.03 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1248  KWG repeat protein  29.62 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.629707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  30.6 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  24.92 
 
 		 340 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.65 
 
 		 906 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  31.91 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  34.39 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1108  hypothetical protein  25.16 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  30 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4415  hypothetical protein  27.41 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1612  hypothetical protein  24.47 
 
 		 583 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0104382  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  23.08 
 
 		 515 aa  93.6  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  31.72 
 
 		 419 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  28.27 
 
 		 696 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  28.05 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  23.57 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0838  KWG repeat protein  26.19 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  26.49 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  25.17 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  23.33 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0435  putative lipoprotein  24.03 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01890  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1023 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4935  KWG repeat protein  31.97 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0212827  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0391  hypothetical protein  28.77 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.05 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  27.67 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  29.01 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1143 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3258  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 850 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1198  hypothetical protein  27.91 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.893535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0032  KWG repeat protein  29.1 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0720  KWG repeat protein  31.54 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0482  KWG repeat protein  22.93 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  26.44 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0332  hypothetical protein  30.36 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2519  Serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0473066  normal  0.232643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0723  KWG repeat protein  33.33 
 
 		 89 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3309  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1075 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.317295 
 
 
-
 
NC_002978  WD0614  hypothetical protein  24.86 
 
 		 564 aa  53.1  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.119775  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0883  hypothetical protein  35.53 
 
 		 181 aa  52.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00144934  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1192  hypothetical protein  24.44 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1003  lipoprotein  27.54 
 
 		 158 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.186888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1339  KWG repeat protein  27.36 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  35.94 
 
 		 107 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4619  hypothetical protein  21.05 
 
 		 636 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1085  hypothetical protein  41.51 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.21 
 
 		 636 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.582346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>