24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1151    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  91.36 
 
 		 565 aa  1021    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.46 
 
 		 906 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  27.67 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  24.76 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  24.24 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  24.9 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  22.54 
 
 		 356 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  22.12 
 
 		 331 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  24.26 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  26.81 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  24.92 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  23.29 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  21.75 
 
 		 340 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  27.01 
 
 		 665 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  39.74 
 
 		 107 aa  47.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1862  KWG repeat protein  25.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  23.21 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3541  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1143 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.604889  hitchhiker  0.00807963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7141  KWG repeat protein  24.88 
 
 		 461 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  21.21 
 
 		 515 aa  44.3  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1486  hypothetical protein  39.66 
 
 		 316 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  24.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>